由于總面積是一定的，而許多第三方物流企業(yè)在建造自動化立體倉庫時只重視辦公、實驗(包括研發(fā))的面積，卻忽視了庫房面積，因此造成了這種局面，即為了滿足庫容量的需要，只好通過向空間發(fā)展來達到要求。但是貨架越高，機械設備的采購成本和運行成本也就越高。除此之外，由于自動化立體倉庫內優(yōu)的物流路線是直線形的，但在倉庫設計時往往會受到平面面積的限制，造成本身物流路線的迂回(往往是s形，甚至是網狀)，這會增加許多不必要的投入和麻煩。

不管自動化立體倉庫的自動化程度有多高，具體運作時仍需要一定的人工勞動，因此工作人員的數(shù)量要合適。人員不足會降低倉庫的效率，太多又會造成浪費。自動化立體倉庫采用了大量的設備，因此對人員的素質要求比較高，人員素質跟不上，同樣會降低倉庫的吞吐能力。第三方物流企業(yè)需要招聘的人才，并對其進行的培訓。

自動化立體倉庫的上游、下游及其內部各子系統(tǒng)的協(xié)調，有一個木桶效應的問題，即短的那一塊木板決定了木桶的容量。有的倉庫采用了很多的高科技產品，各種設施設備也非常，但是由于各子系統(tǒng)間協(xié)調性、兼容性不好，造成整體運作能力比預期差很多。

組成部分
1、貨架:用于存儲貨物的鋼結構。主要有焊接式貨架和組合式貨架兩種基本形式。
2、托盤（貨箱）：用于承載貨物的器具，亦稱工位器具。
3、巷道堆垛機:用于自動存取貨物的設備。按結構形式分為單立柱和雙立柱兩種基本形式；按服務方式分為直道、彎道和轉移車三種基本形式。
4、輸送機系統(tǒng):立體庫的主要外圍設備，負責將貨物運送到堆垛機或從堆垛機將貨物移走。輸送機種類非常多，常見的有輥道輸送機，鏈條輸送機，升降臺，分配車，提升機，皮帶機等。
5、AGV系統(tǒng):即自動導向小車。根據(jù)其導向方式分為感應式導向小車和激光導向小車。
6、自動控制系統(tǒng):驅動自動化立體庫系統(tǒng)各設備的自動控制系統(tǒng)。以采用現(xiàn)場總線方式為控制模式為主。
7、儲存信息管理系統(tǒng):亦稱中央計算機管理系統(tǒng)。是全自動化立體庫系統(tǒng)的核心。典型的自動化立體庫系統(tǒng)均采用大型的數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)（如ORACLE，SYBASE等）構筑典型的客戶機/服務器體系，可以與其他系統(tǒng)（如ERP系統(tǒng)等）聯(lián)網或集成。

提高空間利用率
早期立體倉庫的構想，其基本出發(fā)點就是提高空間利用率，充分節(jié)約有限且寶貴的土地。在西方有些發(fā)達國家，提高空間利用率的觀點已有更廣泛深刻的含義，節(jié)約土地，已與節(jié)約能源、環(huán)境保護等更多的方面聯(lián)系起來。有些甚至把空間的利用率作為系統(tǒng)合理性和性考核的重要指標來對待。
立體庫的空間利用率與其規(guī)劃緊密相連。一般來說，自動化高架倉庫其空間利用率為普通平庫的2-5倍。這是相當可觀的。
隨著經濟全球化步伐的加快，物流供應鏈中蘊藏的潛力越來越引起人們的注意。而物流中心則是物流供應鏈中重要的樞紐之一。它是接受并處理下游用戶的訂貨信息，對上游供應方的大批量貨物進行集中儲存、加工等作業(yè)，并向下游進行批量轉運的設施和機構。而實現(xiàn)這些功能的直接執(zhí)行機構包括：
（1） 自動倉儲設備（自動化立體倉庫）
（2） 其它貨架（平面托盤貨架與流動貨架等）
（3） 各種輸送機（輥道輸送機、鏈條輸送機、皮帶輸送機、升降移載機、提升機等）
（4） 各種分揀設備
（5） 無人臺車（AGV、RGV、LGV）
（6） 其它各種輔助設備
確定自動化立體倉庫的主要形式及相關參數(shù)
所有原始資料收集完畢后，可根據(jù)這些手資料計算出設計時所需的相關參數(shù)，包括：①對整個庫區(qū)的出入庫總量要求，亦即倉庫的流量要求：②貨物單元的外形尺寸及其重量；⑤倉庫儲存區(qū)（貨架區(qū)）的倉位數(shù)量：④結合上述三點確定儲存區(qū)（貨架廠）貨架的排數(shù)、列數(shù)及巷道數(shù)目其它相關技術參數(shù)。
堆垛機
堆垛機是整個自動化立體倉庫的核心設備，通過手動操作、半自動操作或全自動操作實現(xiàn)把貨物從一處搬運到另一處。它由機架（上橫梁、下橫梁、立柱）、水平行走機構、提升機構、載貨臺、貨叉及電氣控制系統(tǒng)構成。
①堆垛機形式的確定：堆垛機形式多種多樣，包括單軌巷道式堆垛機、雙軌巷道式堆垛機、轉巷道式堆株機、單立柱堆垛機、雙立柱堆垛機等等。
②堆垛機速度的確定：根據(jù)倉庫的流量要求，計算出堆垛機的水平速度、提升速度及貨叉速度。
③其它參數(shù)及配置：據(jù)倉庫現(xiàn)場情況及用戶的要求選定堆垛機的定位方式、通訊方式等。堆垛機的配置可高可低，視具體情況而定。
板材存儲需要用到倉庫貨架，以前多半使用橫梁式板材貨架存儲，存儲量及效率都相對較低。所以如今很多企業(yè)會考慮使用自動化板材立體倉庫貨架，以降本增效。