集裝箱運(yùn)輸中的港口的投資也相當(dāng)大。集裝箱泊位的碼頭設(shè)施包括碼頭岸線和、貨場(chǎng)、貨運(yùn)站、維修車間、控制塔、門房，以及集裝箱裝卸機(jī)械等，耗資。

為開展集裝箱多式聯(lián)運(yùn)，還需有相應(yīng)的內(nèi)際設(shè)施及內(nèi)陸貨運(yùn)站等，為了配套建設(shè)，這就需要興建、擴(kuò)建、改造、更新現(xiàn)有的公路、鐵路、橋梁、涵洞等，這方面的投資更是驚人。可見，沒有足夠的資金開展集裝箱運(yùn)輸，實(shí)現(xiàn)集裝箱化是困難的，根據(jù)國(guó)力量力而行，后實(shí)現(xiàn)集裝箱化。

集裝箱運(yùn)輸涉及面廣、環(huán)節(jié)多、影響大，是一個(gè)復(fù)雜的運(yùn)輸系統(tǒng)工程。集裝箱運(yùn)輸系統(tǒng)包括海運(yùn)、陸運(yùn)、空運(yùn)、港口、貨運(yùn)站以及與集裝箱運(yùn)輸有關(guān)的海關(guān)、商檢、船舶代理公司、貨運(yùn)代理公司等單位和部門。如果互相配合不當(dāng)，就會(huì)影響整個(gè)運(yùn)輸系統(tǒng)功能的發(fā)揮，如果某一環(huán)節(jié)失誤，必將影響全局，甚至導(dǎo)致運(yùn)輸生產(chǎn)停頓和中斷。因此，要求搞好整個(gè)運(yùn)輸系統(tǒng)各環(huán)節(jié)、各部門之間的高度協(xié)作。